Мутанты продолжают свою борьбу против общества, которое пугает их и которому они не доверяют. Их ситуация становится еще более бедственной, когда они подвергаются мощной атаке со стороны таинственного противника, обладающего невероятными способностями. Неожиданное нападение вызывает новую волну политических и социальных возмущений, связанных с введением обязательной регистрации всех мутантов. Оно также приводит к формированию движения, противостоящего мутантам, которое возглавляет Уильям Страйкер, бывший военный, о котором ходят слухи, будто он проводил жестокие эксперименты над мутантами.